积极推进污水处理提质增效“333”行动，树立全过程管理理念，持续开展“三消除”、“三整治”、“三提升”工作，加强新技术、新材料、新工艺运用，按照区、区镇(街道)、社区分层级推进“污水处理提质增效达标区”建设，全区共建设175个污水处理提质增效达标区。至2025年底，城市建成区、长三角生态绿色一体化发展示范区先行启动区和江南水乡古镇区(同里、黎里、震泽等)90%以上面积、区镇(含被撤并乡镇)建成区80%以上面积建成“污水处理提质增效达标区”。
全面摸排“小散乱”排水、阳台和单位内部排水，建立问题清单和任务清单，及时整治到位。全面排查城镇建成区沿河排水口、入河排污口、暗涵内排口、沿河截流管道等，重点解决旱天污水直排，有效管控雨天合流制溢流污染，消除污水直排口。全面排查污水管网覆盖现状，划定管网覆盖空白区或薄弱区域，有序推进区域污水管网建设、雨污分流工作，提升污水收集能力，消除污水管网空白区。高标准实施管网工程建设，提升新建污水管网质量管控水平。全面排查检测雨污水管网功能性和结构性状况，分片推进管网改造与修复，提升污水管网检测修复和养护管理水平。2025年，生活污水处理率城市达到98%，集镇达到92%。
加快统筹建设生活污水厂污泥综合利用或永久性处理处置设施，同步建设管网清疏污泥综合利用或处理设施。建立污泥转运和处理处置全过程可追溯的监管体系。对生活污水处理设施产生的污泥进行稳定化、无害化和资源化处理处置，禁止不达标的污泥进入耕地，取缔非法污泥堆放点。污泥无害化处理处置率100%。
加强医疗污水处理监管。以定点收治医院、集中隔离医学观察点以及接纳其污水的城镇污水处理厂为重点，扎实做好新冠肺炎疫情防控期间医疗污水和城镇污水处理监管工作，规范医疗污水应急处理、杀菌消毒要求，切实做好医疗污水收集、污染治理设施运行、污染物排放等监督管理，防止二次污染。完善医疗机构污水处理和消毒设施，做到达标排放。
提高初期雨水污染治理能力。加强城市建成区初期雨水的管控，结合海绵城市建设，遵循“渗、滞、蓄、净、用、排”理念，因地制宜开展初期雨水截留纳管、初期雨水处理设施建设，推动雨水收集和资源化利用。探索将城镇雨洪排口纳入监测管理等日常监管。
三、加强农业农村水污染治理
强化农业面源管控力度。适度优化种植结构，完善农业产业准入负面清单制度。深化高标准农田生态化改造，开展农作物病虫害绿色防控，推进化肥农药减量增效，加强农膜回收利用，实施农田排灌系统生态化改造，推进农田退水净化利用，力争实现“退水不直排、肥水不下河、养分再循环”。到2025年，水稻测深施肥插秧机占乘坐式插秧机的总量比例达50%以上，病虫害绿色防控覆盖率达65%以上，农膜基本实现全量回收。结合《江苏省“十四五”地表水环境监测网设置方案》，全面开展重点地区农田退水水质监测，对确定直接影响断面水质稳定达标的沿岸农田进行种植结构调整，开展排灌系统生态化改造或建设分布式污水处理设施。推进建设全区农业面源监测体系，制订相关管理制度，进一步明确监管责任，探索建设农业面源污染监测“一张网”。
推进畜禽养殖场粪污综合利用和污染治理。开展标准化生态健康养殖普及行动，着力打造一批种养加结合、生态循环畜牧业绿色生产示范基地。探索建立分散养殖粪污收集、贮存、处理与利用体系，提升工厂化堆肥处理规模，推广高效液态有机肥生产技术，鼓励开展屠宰废水等农产品加工业废水无害化处理和循环利用。支持在田间地头配套建设管网和储粪(液)池等基础设施，解决粪肥还田‘最后一公里’问题，新建养殖场应采取生物、工程、农业等措施利用畜禽粪污，新建、改建、扩建规模化畜禽养殖场(小区)要实施雨污分流、粪便污水资源化利用，畜禽散养密集区应对畜禽粪便污水进行分户收集、集中处理利用。建立健全粪肥还田监管体系和制度，强化过程监管，防止随农田退水进入水体，造成二次污染。加快养殖场设施装备改造提升，推行清洁生产，推广节水、节料、节能养殖工艺，提高畜禽养殖自动化、智能化、规范化水平。
推进水产生态健康养殖。推进落实养殖水域滩涂规划，加强养殖区、限养区、禁养区管理。按照新出台的池塘养殖尾水排放强制性标准，加快推进养殖池塘生态化改造，分类建立池塘生态化改造方案，组织开展池塘养殖尾水专项整治行动，重点检查养殖池塘生态化改造完成情况、尾水处理设施正常运行情况以及养殖尾水达标排放情况。开展百亩以上连片养殖池塘尾水达标排放或循环利用试点示范，促进养殖尾水达标排放。强化水产养殖投入品监管，提升水产健康养殖水平，严格控制河流湖库投饵网箱养殖，限制使用抗生素等化学药品，加强人工配合饲料推广，逐步减少冰鲜杂鱼饲料直接投喂。规范设置养殖尾水排放口，开展水产养殖尾水排放排口监测网络建设，对超标排放的养殖尾水进行限期整治，逾期整治未完成的，依法进行查处。到2025年，全面完成全区池塘改造提升任务，实现池塘生态化改造全覆盖，水产养殖主产区规模以上养殖池塘实现尾水达标排放或循环利用。
建设美丽宜居乡村环境。加快推进农村污水处理设施建设，根据农村生活污水处理设施新地标要求，尽快开展已建污水处理设施提标改造，2025年农村生活污水治理率达到95%。完善农村生活污水治理长效管理机制，加强处理设施标准化运维服务能力，结合农田灌溉回用、生态保护修复和环境景观建设，推动水资源和氮磷资源的循环利用。深入推进厕所革命，全面推进实施厕所粪污治理，切实加强农村公厕建改与农村生活污水治理有效衔接，确保厕所粪污得到无害化处理或资源化利用。
恢复提升农村生态系统功能。深入实施农村清洁河道行动，建设生态清洁型小流域，推动河湖长制向村级延伸，确保农村河道综合管护实现全覆盖。贯通畅活农村河道水系，加快推进农村水利工程提档升级改造，充分利用现有沟、塘、渠等，建设生态安全缓冲区、生态沟渠、地表径流集蓄与再利用设施，有效拦截和消纳农田退水和农村生活污水中各类污染物。实施耕地质量保护与提升行动，在粮食主产区实施强酸性土壤降酸改良工程，提升耕地质量，提高粮食生产能力。构建环境友好型的种植制度和轮作休耕机制，4年左右轮作休耕一遍，示范推广种地养地和综合治理相结合的耕地轮作换茬与休耕培肥模式，合理搭配不同类型作物和种植方式来提升耕地地力，强化检疫性有害生物防控，逐步恢复田间生物群落和生态链。