推进种植污染管控。推进“源头减量—循环利用—过程拦截—末端治理”全链条污染防治。适度优化种植结构，发展节水型农业，加强农业投入品规范化管理。持续推进化肥、农药减量增效，降低耕地开发利用强度，增加测土配方施肥技术面积，推进农作物重大病虫害统防统治和绿色防控。强化秸秆综合利用。建设生态沟渠、污水净化槽、地表径流集蓄池等设施，通过调蓄塘、生态塘等技术净化农田排水及种植区地表径流，有效减少农田退水对水体的污染。到2025年，全市主要农作物测土配方施肥技术实现全覆盖，化肥、农药利用率分别达到43.5%和50%。
提升农村生活污水治理水平。实施县域农村生活污水治理专项规划，梯次推进农村生活污水治理，优先治理水源保护区、黑臭水体集中区域、乡镇政府所在地、中心村、城乡结合部、旅游风景区等六类村庄生活污水。因地制宜推进农村改厕，加强厕所粪污治理，鼓励卫生厕所改造与生活污水治理一体化建设，暂时无法同步建设的应为后期建设预留空间。深入推进农村生活污水治理设施建设，在有条件的地区建设农村生活污水分散或集中式处理设施，鼓励生活污水资源化利用。加强农村生活污水处理设施建设和运行维护管理，提高农村生活污水处理设施正常运行率。到2025年，农村生活污水治理率达到40%。
积极推动农村生活垃圾治理。统筹县乡村三级设施建设和服务，完善农村生活垃圾收集、转运、处置设施和模式，加强日常管护，提升管理水平，确保稳定运行，率先在饮用水水源周边和河湖岸滩开展垃圾清理。推动农村生活垃圾就地分类和资源化利用，减少垃圾出村处理量。
积极预防水产养殖污染。指导各县(市)区合理发展湖泊、水库等大水面“放牧式”生态渔业增养殖模式，鼓励在湖泊、水库等大水面发展鲢、鳙、草鱼等滤食性、草食性鱼类，实现以渔抑藻、以渔净水、以渔控草。积极开展国家级水产健康养殖和生态养殖示范区创建活动，推进水产养殖业绿色发展。
(三)保障河湖生态用水
1.优化水资源配置
合理规划和开发利用水资源，应当首先满足城乡居民生活用水，统筹兼顾农业用水、生态用水、工业用水和航运等用水需要;兼顾上下游、左右岸和地区间的利益，充分发挥水资源的综合效益。坚持优先利用地表水、合理开发利用浅层地下水、严格限制开采深层承压地下水的原则，服从防洪的总体安排，兴利与除害并举，确保水资源的可持续利用。开发利用水资源，应当按照流域、区域进行统一规划。综合规划应当与国土规划相协调，并纳入本行政区域国民经济和社会发展规划。开发利用水资源，用于农田灌溉、工业生产和城市生活供水的，应当采用先进的节约用水技术、工艺和设备加强对水的重复利用和循环利用，提高水的重复利用率。利用现有的水利工程，合理调度，优化配置水资源，保障河道正常生态用水需求。
2.提高水资源利用效率
强化用水总量强度双控。加强用水效率控制红线管理，健全省、市、县三级行政区域用水总量和用水强度控制指标体系，实行最严格水资源管理制度考核。到2025年，全市用水总量控制在57.31亿立方米以内，全市万元国内生产总值用水量、万元工业增加值用水量逐年持续下降，较2020年分别降低12%和13%。
加强农业节水。根据水资源条件，适水种植、量水生产，大力发展旱作农业，严格控制旱改水。推行农业灌溉用水总量控制和定额管理，加强农业取水许可管理。到2025年，全市新建高标准农田540万亩，其中新增高效节水灌溉面积49万亩;推进节水型灌区创建工作，农田灌溉水有效利用系数保持在0.61左右。
加强工业和城镇节水。大力推进工业节水改造，推广循环用水等工业节水技术，支持企业开展再生水回用改造。对超过取水定额标准的企业分类分步限期实施节水改造。推动高耗水行业节水增效，采用差别水价以及树立节水标杆等措施，促进高耗水企业加强废水深度处理和达标再利用。将节水落实到城市规划、建设、管理各环节，积极推进老旧供水管网改造，到2025年，城市供水管道漏损率控制在10%以内。
3.有效保障生态流量
积极推进河湖生态流量管理。有序提出生态流量管理重点河湖名录，推进生态流量管理全覆盖。落实讷谟尔河、乌裕尔河等河流生态流量管理措施，保障河流生态流量目标。科学制定双阳河等河流生态流量保障目标，加强流域水量统一调度，合理配置水资源。到2025年，生态流量管理措施基本落实，嫩江干流及主要支流生态流量保障程度显著提升。
加强江河湖库水量配置与调度管理。强化水资源统筹调度，深化流域水资源统筹调度协商工作机制，科学制定江河流域水量调度方案和计划。以重要水利水电工程和水资源配置工程为重点，制定河湖生态流量调度方案，逐个落实水利水电工程生态流量下泄措施，可以调蓄的水库工程要明确提出生态流量泄放设施的建设且需独立运行，不受主体工程运行限制。对中小河流，研究建立小水电退出机制。到2025年，力争实现无河流断流河段。
加强河湖生态流量监测。加快建设生态流量控制断面的监测设施，提高重要水文断面生态流量以及河流小流量时的测报精度，尤其提高非汛期生态流量测报能力。推进干流取水口计量设施建设，开展水文监测工作，依托国家水资源监控管理信息平台等信息化平台，以现场检查、台账查询、动态监控等方法，全面提高生态流量保障工作信息化水平。
(四)推动水生态保护修复
1.湿地恢复与建设
构建齐齐哈尔市“一核、四线、多点”的湿地保护格局，加强扎龙、乌裕尔河湿地等湿地生态修复，重点推进松嫩平原乌裕尔河等流域湿地恢复工程。逐步恢复湿地生态功能，增强湿地碳汇功能，维持湿地生态系统健康。到2025年，全市恢复湿地总面积不低于500公顷。